Aplicaciones de la Teoría de la Información al procesamiento de datos de secuenciación de genomas por nanoporos
Programa:
Año:
2016
Área Proyecto:
Tecnológica
En 2015 se liberó la primera versión comercial de un secuenciador de genomas por nanoporos, una tecnología que se perfila como la próxima generación de instrumentos de secuenciación. Este tipo de secuenciadores generan lecturas de fragmentos de secuencia de ADN, \emph{reads}, muy largos, lo cual en general es ventajoso, pero con una tasa de errores de lectura elevada. Determinados tipos de procesamiento sobre reads con estas características demandan un tratamiento específico, que no siempre ha sido investigado profundamente, y que pensamos que va a tener una importancia central en la medida que el uso de esta tecnología se difunda. En este proyecto nos proponemos investigar algoritmos de compresión para diversos tipos de datos de secuenciación por nanoporos y la aplicación de técnicas de reducción de ruido.
Responsables:
Monto total:
$998445.00